خلاصه فیلم

شش ماه از حوادث فیلم اول گذشته است . در طی این مدت بخاطر تلاشهای نئو جمعیت اندک انسانهای شهر مخفی زئون رو به افزایش گذاشته است . توجه کامپیوترهای حاکم به رشد جمعیت این شهر جلب شده و آنرا خطری برای خود می دانند بنابراین قصد دارند تا با اعزام یک نیروی ۲۵۰ هزار نفری از سنتینل ها شهر را در عرض ۷۲ ساعت نابود کنند . در همین زمان رهبران زئون خود را برای مبارزه آماده می کنند و نئو را بعنوان منجی به ماتریکس می فرستند تا به دیدار اوراکل (پیشگو) برود . اوراکل او را ترغیب می کند تا بدنبال مردی به نام کلید ساز بگردد . پس از این ملاقات ، مامور اسمیت که اکنون قادرست خود را تکثیر کند از راه می رسد و با نئو درگیر می شود . پس از پایان این مبارزه نئو بهمراه ترینیتی و مورفیوس جستجو برای یافتن کلید ساز را آغاز می کند . در ادامه آنها به دیدار مرو ونژیان می روند تا از محل کلید ساز مطلع شوند اما در آنجا با وی و افرادش درگیر می شوند اما سرانجام موفق می شوند بکمک پرسفون همسر مرو ونژیان و پس از یک مبارزه مهلک و تعقیب و گریز در یک بزرگراه ، کلید ساز را بدست آورند . نئو به کمک کلید ساز وارد مقر آرشیتکت ، خالق ماتریکس می شود . نئو به گفته های آرشیتکت گوش فرا می دهد . او از راهکارهایی که در پیش روی خود دارد مطلع شده و به حقیقت و ماهیت ماتریکس پی می برد . در ادامه ماشینها وارد قرارگاه انسانها می شوند و نئو و همراهانش فرصت کوتاهی دارند تا راه حلی را برای نجات بشر بیابند